Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms