Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms