Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gdf9Q07105 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms