Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms