Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cab39Q06138 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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