Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms