Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms