Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1sQ02789 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms