Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms