Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnb1Q02248 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms