Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms