Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms