Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms