Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms