Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VldlrP98156 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VldlrP98156 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms