Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms