Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc35b1P97858 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms