Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
AlkP97793 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AlkP97793 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AlkP97793 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AlkP97793 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AlkP97793 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AlkP97793 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms