Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms