Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
rp9P97762 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
rp9P97762 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
rp9P97762 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
rp9P97762 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
rp9P97762 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms