Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2cP97760 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms