Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab3P97382 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms