Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmsP97355 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SmsP97355 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SmsP97355 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SmsP97355 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmsP97355 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SmsP97355 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SmsP97355 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms