Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms