Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ptprn2P80560 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ptprn2P80560 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ptprn2P80560 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprn2P80560 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms