Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otx2P80206 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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