Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms