Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux2P70298 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux2P70298 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cux2P70298 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux2P70298 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux2P70298 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms