Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrig1P70193 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms