Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms