Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms