Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnab1P63143 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms