Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl8P62918 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl8P62918 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl8P62918 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms