Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snrpd3P62320 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snrpd3P62320 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms