Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms