Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc5P61460 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms