Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Megf8P60882 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms