Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ActbP60710 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ActbP60710 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ActbP60710 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ActbP60710 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ActbP60710 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ActbP60710 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ActbP60710 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ActbP60710 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ActbP60710 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms