Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bace1P56818 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms