Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms