Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms