Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp5eP56382 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms