Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp1P56183 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms