Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms