Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms