Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2e3P52483 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms