Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms