Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa6P50704 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms