Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms