Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmod1P49813 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tmod1P49813 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tmod1P49813 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tmod1P49813 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tmod1P49813 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmod1P49813 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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